La qualité de l’eau est un sujet de première importance ; Qu’il s’agisse de l’eau distribuée, ou de l’eau prélevée dans le milieu naturel pour la rendre potable. Dans ce domaine, le SMIPEP et son fermier mènent une politique d’amélioration constante de la qualité de l’eau, afin de satisfaire au mieux les communes desservies. Ces améliorations concernent non seulement le suivi et l’optimisation permanente des usines de production, mais aussi du réseau de transport.

Tout au long de son cycle, l’eau subit des transformations d’état : tantôt liquide, tantôt solide, tantôt vapeur. Parallèlement, elle se charge ou se décharge d’éléments divers, solides ou dissous, minéraux ou organiques…

Les éléments de nature biologique :
On y trouve les bactéries, virus, macro- et micro-organismes divers (phytoplancton, zooplancton, parasites…). Quels qu’ils soient, des plus inoffensifs aux plus pathogènes, leur présence dans l’eau distribuée est à proscrire. Outre le risque bien réel de provoquer des maladies graves pour certains d’entre eux (les organismes pathogènes), ceux dit « banals » sont susceptible de provoquer des problèmes dans les réseaux de distribution : prolifération, consommation de l’oxygène dissous et du chlore résiduel, dépôts, corrosion, et apparition de mauvais goûts.

Les éléments de nature minérale :
Certains de ces éléments ont une influence sur les qualités organoleptiques de l’eau, son aspect esthétique, ou son comportement dans le réseau de distribution, mais sont sans effet appréciable sur la santé du consommateur, alors que d’autres ont un effet reconnu.
Parmi les impuretés sans effets notables sur la santé, on trouve la turbidité, la couleur, la minéralisation (alcalinité et dureté), ainsi que certains métaux comme le fer, le manganèse, le cuivre, le zinc. Il est néanmoins indispensable de les éliminer dès lors qu’ils atteignent des quantités trop importantes, susceptibles d’avoir un effet néfaste sur la santé, le traitement de l’eau ou les réseaux.
Les impuretés affectant la santé sont principalement des métaux comme le cadmium, le chrome, le plomb, le mercure, le sélénium, l’arsenic…mais on trouve aussi des éléments comme les nitrates (effets discutés) et le fluor.

Les éléments de nature organique :
Ces éléments organiques peuvent être d’origine naturelle, c'est-à-dire issus des êtres vivants animaux ou végétaux. Ce sont par exemple les protéines, les acides aminés, les sucres, les substances humiques, etc… Mais les éléments organiques peuvent aussi être d’origine anthropique, rejetés par le biais de la chimie et de l’industrie de synthèse organique (produits phytosanitaires, solvants chlorés, phénols, hydrocarbures, PCB, détergents…).